הברון בנימין אדמונד רוטשילד, הנדיב הידוע, בנה את בית הכנסת הזה כמתנת פרדה למושבה שתמך בה מראשיתה ונקראה על שם אמו. את הבניין, בעל החזית המפוארת בסגנון אקלקטי-אירופי, תכנן האדריכל פנחס היט, והוא נחנך בשנת תרפ”ז (1927). בית הכנסת הראשון של המושבה, שעמד מול בית הפקידות (כיום המוזיאון) נהרס, מפני שיסודותיו התערערו, אבל ארון הקודש ואבזרים נוספים הועברו ממנו לבניין החדש.
בתקופת המנדט הבריטי היה” סליק” (מחבוא לנשק) בבניין בית הכנסת, מתחת לבמה המרכזית.
השימור והשיפוץ של הבניין, שהסתיימו בשנת 1989 זכו לאות הוקרה מהמועצה לשימור מבנים ואתרים היסטוריים.